La Asociación de Familias del Alumnado (AFA) del CEIPSO San Sebastián es el principal instrumento de organización y representación a disposición de las familias que forman parte del Centro. A grandes rasgos, su misión consiste en formar parte de la comunidad educativa trabajando y colaborando a la par con el colegio desde el ámbito familiar, con el objetivo de desarrollar y mejorar la experiencia educativa de los/as alumnos/as del Centro, entendida en los más amplios términos. De esta manera, se persigue consolidar el papel del Centro como un elemento vertebrador central dentro de la vida del municipio.